Křen má málo kalorií a tuku. Obsahuje však hodně vlákniny, vitamínů, minerálů a antioxidantů. Má také protizánětlivé, diuretické a nervy zklidňující účinky. Kořen obsahuje mnohé fytochemické složky, které mu dávají jeho typickou chuť. Tyto složky mají také antioxidační a detoxikační účinky.

Křen funguje jako silný stimulant trávicího systému, zvyšuje chuť k jídlu a pomáhá při trávení. Některé z fytochemických složek stimulují sliny a trávicí žlázy k produkci trávicích enzymů.

Křen má velké množství vitamínu C, který je mocným antioxidantem. 100 g čerstvého kořene má 29 mg nebo 41% DDD vitamínu C. Vitamín C pomáhá likvidovat virové infekce tím, že posiluje imunitu těla. Navíc ještě pomáhá odstraňovat škodlivé volné radikály a chránit tak tělo před rakovinou, záněty, infekcemi apod.

Křen také obsahuje přiměřené množství životně důležitých minerálů jako např. sodík, draslík, mangan, železo, měď, zinek a magnesium. Navíc křen obsahuje také menší množství esenciálních vitamínů jako foláty, vitamín B6, riboflavin, niacin a kyselinu pantothenovou.